上海海關學院是海關總署唯一直屬的全日制本科高等學校。前身為創建于1953年的上海海關學校；1980年5月，經國務院批準，升格為上海海關專科學校；1996年4月，原國家教委批準更名為上海海關高等專科學校；2007年3月，經教育部批準，設立上海海關學院，成為新設置的全日制普通高等學校。2018年5月，學校獲批成為碩士學位授予單位，同時獲批公共管理以及稅務2個碩士專業學位授權點，辦學層次實現跨越，同年海關管理專業成為世界海關組織PICARD標準認證專業。2019年，學校獲批1個國家級一流本科專業建設點和1個省級一流本科專業建設點。2021年，學校設立上海海關學院臨港國際校區，同時獲批國際商務、翻譯碩士2個專業學位授權點，順利納入上海市博士授予單位培育建設名單以及上海市博士后流動站建設籌備單位名單。

學校現設有海關與公共管理學院、海關與公共經濟學院、工商管理與關務學院、海關法律系、海關外語系、公共教學部、馬克思主義學院和檢驗檢疫技術交流部等八個院（系）；設置了海關管理、海關檢驗檢疫安全、海關稽查、行政管理、物流管理、審計學、國際商務、稅收學、經濟統計學、法學、英語等11個本科專業和公共管理碩士、稅務碩士、國際商務、翻譯碩士4個專業學位點，分屬管理學、經濟學、法學、文學等學科門類。

學校始終堅持社會主義辦學方向，全面貫徹黨的教育方針，落實立德樹人的根本任務，扎根中國大地、對標海關行業需求，圍繞人才強校、關校合作、國際化三大發展戰略，堅持立地頂天，依特做特，以特促強，走特色辦學的內涵發展之路，培養符合海關事業和經濟社會發展需要的應用型、復合型、涉外型的高素質海關管理專業人才以及服務口岸物流和國際商務的外經貿專業人才，并積極開展海關理論研究和國際交流。學校同時承擔海關系統中、高級干部繼續教育、知識更新和業務培訓等任務；并根據世界海關組織（WCO）的分工和亞太區域國家和地區的要求，逐步承擔該區域海關人員培訓任務，履行相應的國際義務。學校以建設海關特色鮮明、服務國家戰略、具有國際影響力的一流高等學府為目標，主動跟進海關改革與發展的實踐，為建設新時代社會主義現代化海關貢獻更多力量。

截止至2022年8月31日，學校擁有專任教師166人，其中教授18人，副教授49人，具有高級專業技術職務教師的比例為40.36 %。具有博士學位教師104人、碩士學位教師44人，具有研究生學歷教師的比例為89.16%。師資隊伍結構合理，教學科研水平較高。學校設有海關管理研究所和海關法、海關風險管理、關稅、海關公共關系、報關等研究中心，緊密結合海關改革發展和雙邊、多邊、區域海關國際合作中面臨的熱點、難點問題開展科學研究。2009年，學校獲準設立上海市社會科學創新研究基地、上海發展戰略研究所工作室。公開出版學術期刊《海關與經貿研究》。

學校位于上海市浦東新區，占地面積521畝。下設蘇州分校，位于蘇州市吳中區，占地133畝。按照教育部普通高等學校設置標準，學校建有現代化的教學樓、圖書館和先進的ATM校園網，教室都具備多媒體授課的條件；并建有數碼閱覽室、視聽室、文娛活動綜合樓、網球場、游泳館、體育館等配套設施，為學生營造一個良好的學習和生活環境。

學校始終凸顯以“愛國明志、開放博學”為內涵的“大學精神”教育，注重學生的全面發展，學生綜合素質教育、準軍事化管理貫穿于人才培養的全過程；學校始終以教學、科研、培訓為中心，以學科專業建設為龍頭，轉變教育教學觀念，深化教育教學改革，創新人才培養模式，實施以德育為核心的綜合素質教育，培養學生實踐能力和創新精神，促進學生個性化發展，全面提高本科人才培養質量。