新疆第二醫學院是一所以醫學類為主，理學、管理學等多學科協調發展的自治區直屬全日制普通本科高校。學院前身是新疆醫科大學厚博學院，創辦于2003年，為全日制普通本科獨立學院。2012年，經自治區人民政府批準，新疆醫科大學與克拉瑪依市采取合作辦學的方式共同建設厚博學院。2015年9月，厚博學院整體遷至克拉瑪依市。2021年1月，國家教育部批準厚博學院轉設為新疆第二醫學院。

學院占地面積1100余畝，建筑面積達24萬平方米。現有專業實驗室共150間，其中科研實驗室17間，教學科研儀器設備總值6868.1萬元、數量6628臺（套）。圖書館紙質藏書總量39萬余冊，訂購電子期刊5100余種，學位論文217萬余篇。

目前開設臨床醫學、口腔醫學、中西醫臨床醫學、麻醉學、護理學、藥學、醫學影像技術、醫學檢驗技術、衛生檢驗與檢疫、信息管理與信息系統、公共事業管理、預防醫學、智能醫學工程13個專業。現有全日制在校生5500余人，每年面向河北、河南、山東、遼寧、浙江等21個省、自治區、直轄市招生。教職工355人，附屬醫院兼職教師592人。

學院現有2個自治區級一流本科專業建設點，3個自治區級一流本科課程，自治區級教改項目19項。在研項目78項，近三年發表論文62篇，獲批實用新型授權專利3項。獲得自治區自然科學優秀學術論文獎3篇，1名教師獲得市級骨干科技創新人才培養資格，2名教師獲得市級優秀科技創新人才培養資格。

學院先后與自治區人民醫院等多家附屬醫院簽約掛牌，簽約臨床教學實習基地52家，其中三級甲等醫院30家、國家級住培基地14家、自治區級住培基地8家，基本覆蓋南北疆所有地州，構建了“附屬醫院+教學醫院+實習醫院+教學基地”的實踐教學基地體系，推動形成了“以教學帶動醫療、以醫療反哺教學、以科研提升實力”的良好發展格局。